В письме №03-07-15/148, подписанном замминистра финансов Сергеем Шаталовым в середине ноября, делается вывод, что Налоговый кодекс (НК) не ставит возмещение НДС из бюджета в зависимость от налоговой базы по НДС. При этом Минфин ссылается на прецедент Высшего арбитража от мая 2006 года. В начале декабря замруководителя ФНС Даниил Егоров довел позицию ведомства Антона Силуанова до нижестоящих налоговых органов.

По словам старшего партнера «Пепеляев Групп» Рустема Ахметшина, проблеме, затронутой Минфином, как минимум десять лет. «В такие ситуации очень часто попадали налогоплательщики, осуществляющие крупные инвестиционные проекты, или на этапе стартапа», — обращает он внимание.

НК подобную ситуацию никак не оговаривает, комментирует старший юрист юридической фирмы Sameta Юлия Пудыч. «До недавнего времени часто возникали споры бизнеса с ФНС, которая отказывала в вычете на основании отсутствия налоговой базы по НДС. Налоговики ссылались на то, что раз уж никакой деятельности компания в текущий налоговый период якобы не вела, то и возмещать НДС бюджет ей не обязан», — знает она. По словам г-жи Пудыч, судебная практика по возврату НДС в таких ситуациях в 90% случаев складывалась в пользу бизнеса.

«Это символичное письмо, показывающее, что Минфин выравнивает методологические подходы по налогообложению в соответствии с недвусмысленно установившейся практикой судов», — пояснил РБК daily источник в ФНС. В налоговой службе считают, что письмо Минфина поможет разгрузить налоговые органы, когда территориальные инспекторы смогут заниматься более перспективными для ФНС методологическими проблемами налогообложения.

С другой стороны, письмо Минфина должно освободить бизнес от необходимости нести немалые издержки, связанные с судебными спорами с ФНС, замечает партнер АБ «Линия права» Сергей Калинин.

Однако мытарства начинающих предпринимателей на этом могут так и не кончиться. В этом же письме Минфин призывает ФНС проявлять бдительность в отношении недобросовестных налогоплательщиков, которые могут злоупотреблять своим правом на вычет НДС из бюджета применением налоговых вычетов «в крупных суммах». Непонятно, какой именно суммовой порог предъявленного к вычету НДС может заставить заподозрить компанию в налоговой оптимизации. Оперативный комментарий от Минфина вчера получить не удалось.